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JOE 亞磷酰胺，6-異構體 (JOE phosphoramidite, 6-isomer)

JOE 亞磷酰胺，用於寡核苷酸合成，純6-異構體 (6-JOE)。 熒光染料JOE是一種含有兩個氯原子和兩個甲氧基的熒光素衍生物。其最大吸收和最大發射波長分別為 503 nm 和 525 nm。從其光譜特性來看，由於JOE 介於 FAM 和 TAMRA/ROX 之間；因此，這種熒光團通常用於多重檢測，包括 DNA 測序期過程中的多重檢測。 我們的目錄還包含 JOE 亞磷酰胺，5-異構體。我們比較了含有不同 JOE 異構體（5-JOE 和 6-JOE）的 qPCR 探針，發現它們之間沒有顯着差異。 用法 耦合：6分鐘 脫保護：標準條件下使用氫氧化銨；脫保護時間取決於寡核苷酸組成和核鹼基保護基團（在 55 °С 下脫保護 17 小時，可去除標準核鹼基上的所有保護基團）。可與AMA（30% 氫氧化銨/40% 甲胺水溶液，1:1 v/v）一起使用，伴隨5% 的非熒光副產物的形成。為了避免副產物的形成，採用氨水脫保護（室溫下 30 分鐘），添加等體積的 40% 甲胺水溶液，繼續用 AMA 按要求脫保護（例如 65 °C 下 10 分鐘）。