HEX 亞磷醯胺,6-異構體 (HEX phosphoramidite, 6-isomer)

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用於寡核苷酸合成的 HEX 亞磷醯胺,純 6-異構體。 HEX(六氯螢光素)是一種螢光素衍生物,在黃色光譜範圍內發射(最大吸收波長為 533 nm,最大發射波長為 549 nm)。 HEX 亞磷醯胺用於合成螢光標記引物和雜交探針,例如用於 qPCR 的 TaqMan、Molecular Beacon 和 Scorpion。 HEX 能被非螢光 DusQ1 暗猝滅劑有效猝滅,因為它們的光譜顯著重疊(可與孔徑為 500 Å 的 DusQ1 CPG 500 固體支持物配合使用)。許多基於毛細管凝膠電泳的自動測序儀都有 HEX 檢測通道。因此,這種亞磷醯胺常用于合成用於片段分析的 5' 標記寡核苷酸,特別適用于微衛星分析-當使用螢光標記的正向引物和非標記的反向引物擴增微衛星位點時。 用法 偶聯:3 分鐘。 脫保護:標準條件下使用25%氨水;脫保護時間取決於寡核苷酸組成和核堿基保護基團(在 55 °С 下脫保護 17 小時可去除標準核堿基上的所有保護基團)。用AMA(濃氨水/40% 甲胺水溶液 1:1 v/v)可形成約 5% 的非螢光副產物。為了避免副產物的形成,開始用氫氧化銨脫保護(室溫下 30 分鐘),然後添加等體積的 40% 甲胺水溶液,繼續用AMA 按要求脫保護(例如 65 °C 下 10 分鐘)。

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外观:
分子量: 1050.61
CAS 编号: 1360547-55-2
分子式: C46H52N3Cl6O10P
溶解度:
质量控制:
储存条件:
MSDS: 下載
產品規格

激发/吸收极大值,纳米: 533
ε, 摩尔吸光系数,cm⁻¹: 87770
发射极大值,纳米: 549
荧光量子产率: 0.57
CF260: 0.30
CF280: 0.13

稀释剂:
偶联条件:
解保护条件:
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