TAMRA 亞磷酰胺,6-異構體 (TAMRA phosphoramidite, 6-isomer)

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該亞磷酰胺用於合成 5’-TAMRA 標記的寡核苷酸。

TAMRA(羧基四甲基羅丹明)是羅丹明家族中的一種氧雜蒽染料,發射波長在橙色光譜範圍(最大波長為 563 nm)。由於光譜與螢光素 (FAM) 明顯重疊,這種螢光團用作 FRET 受體(和猝滅劑)。因此,這種亞磷酰胺便於合成雙標記探針 TaqMan,該探針在序列中間或 3' 末端含有 5' 端 TAMRA 和 FAM(分別使用螢光素 dT 亞磷酰胺和 FAM CPG)。

TAMRA 5’標記寡核苷酸通常用於定量 PCR 和片段分析(例如,用於微衛星標記分析),因為現有的設備通常具有 TAMRA 檢測通道。

TAMRA 染料在有銨鹽和空間無位阻的伯胺情況下表現不穩定,因此強烈建議遵循指定的條件進行寡核苷酸脫保護。

用法

耦合:7.5 分鐘。

脫保護:叔丁胺:甲醇:水 1 : 1 : 3 (v/v/v)(《TAMRA 雞尾酒》)在 60 °C 下反應 6 小時,然後冷卻至室溫。

由於 TAMRA 染料會完全且不可逆地降解,請勿使用氨水和 AMA 將修飾的寡核苷酸從固相支持物上脫保護。

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外观: 紅色固體
质谱 M+ 增量: 589.60
分子量: 727.83
分子式: C40H50N5O6P
溶解度: 適合乙腈、DCM
质量控制: NMR 1H、HPLC-MS (95%)、耦合測試
储存条件: 儲存:收到後-20℃避光保存12個月。 運輸:室溫最多可保存3週。 避免長時間暴露在光線下。 乾燥。
MSDS: 下載
產品規格

激发/吸收极大值,纳米: 541
ε, 摩尔吸光系数,cm⁻¹: 84000
发射极大值,纳米: 567
CF260: 0.32
CF280: 0.19
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