炔基亞磷酰胺，5'-端 (Alkyne phosphoramidite, 5'-terminal)

Oligonucleotide synthesis Alkynes Phosphoramidites Click chemistry
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亞磷酰胺用於合成具有 5'-末端炔烴的寡核苷酸以進行點擊化學。

與 5'-己炔基亞磷酰胺、5'-丁炔基-CEP 和其他 5'-端炔基亞磷酰胺相比，這種炔亞磷酰胺具有多種優勢。首先，它是固體化合物，更容易處理和分配。並且由於其結構，它在溶液中也更穩定，並且具有更長的保質期

該亞磷酰胺的稀釋劑是乙腈，建議偶聯時間為 5 分鐘。由於該脒基 不含 5'-末端 DMT 基團，因此無需 5'-脫保護。寡核苷酸在標準條件下解封閉，並通過 PAGE 或離子交換 HPLC 純化。

具有這種修飾的寡核苷酸非常適合用於點擊化學（請參閱我們推薦的方案）。

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外观: 無色固體
分子量: 409.50
CAS 编号: 1417539-32-2
分子式: C21H36N3O3P
IUPAC 名称: trans-4-(5-Hexynoylamino)cyclohexyloxy-N,N-diisopropylamino-2-cyanoethyloxyphosphine
溶解度:
质量控制:
储存条件:
MSDS: 下載
產品規格

稀释剂: 乙腈和二氯甲烷溶解良好
偶联条件: 標準偶聯，與正常核堿基相同
切割条件: 標準脫保護
解保护条件: 無需脫保護。與標準脫保護試劑兼容。

產品引用

  1. Farzan, V.M.; Kvach, M.V.; Aparin, I.O.; Kireev, D.E.; Prikazchikova, T.A.; Ustinov, A.V.; Shmanai, V.V.; Shipulin, G.A.; Korshun, V.A.; Zatsepin, T.S. Novel homo Yin-Yang probes improve sensitivity in RT-qPCR detection of low copy HIV RNA. Talanta, 2019, 194, 226–232. doi: 10.1016/j.talanta.2018.10.043
  2. Taskova, M.; Uhd, J.; Miotke, L.; Kubit, M.; Bell, J.; Ji, H.P.; Astakhova, K. Tandem Oligonucleotide Probe Annealing and Elongation To Discriminate Viral Sequence. Analytical Chemistry, 2017, 89(8), 4363–4366. doi: 10.1021/acs.analchem.7b00646
  3. Aparin, I.O.; Farzan, V.M.; Veselova, O.A.; Chistov, A.A.; Podkolzin, A.T.; Ustinov, A.V.; Shipulin, G.A.; Formanovsky, A.A.; Korshun, V.A.; Zatsepin, T.S. 1-Phenylethynylpyrene (PEPy) as a novel blue-emitting dye for qPCR assay. Analyst, 2016, 141, 1331–1338. doi: 10.1039/c5an01767j
  4. Astakhova, I.K.; Santhosh Kumar, T.; Campbell, M.A.; Ustinov, A.V.; Korshun, V.A.; Wengel, J. Branched DNA nanostructures efficiently stabilised and monitored by novel pyrene-perylene 2'-alpha-L-amino-LNA FRET pairs. Chemical Communications, 2013, 49(5), 511-511. doi: 10.1039/c2cc37547h
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